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生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記_2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試生物化學(xué)筆記精選

更新時間:2015-11-13 12:00:01 來源:環(huán)球網(wǎng)校 瀏覽826收藏330

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摘要   2015年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試順利結(jié)束,2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試筆試時間預(yù)計為2016年9月10日、11日。為方便備考2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試的考生復(fù)習(xí),環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記_2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師

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  提要

  一.概述

  酶的特性 (環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)酶的分類

  二.酶的結(jié)構(gòu)

  單純酶 結(jié)合酶 輔酶與輔基 單體酶 寡聚酶 多酶體系 活性中心 同工酶

  三.酶的催化機(jī)制

  誘導(dǎo)契合假說 酶加快反應(yīng)速度的因素

  四.酶促發(fā)應(yīng)動力學(xué)

  米氏方程 米氏常數(shù)及意義 bi-bi反應(yīng) 影響酶促反應(yīng)的因素 激活劑 抑制劑 競爭性抑制 非競爭性抑制

  五.酶的調(diào)節(jié)

  變構(gòu)調(diào)節(jié) 共價修飾調(diào)節(jié) 酶原 酶原激活

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  第一節(jié) 概述

  一、定義

  酶是一種生物催化劑,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)是有催化功能的蛋白質(zhì)。

  二、人們對酶的認(rèn)識過程

  1833年佩延(Payen)和Persoz從麥芽中抽提出一種對熱敏感的物質(zhì),這種物質(zhì)能將淀粉水解成可溶性糖,被稱為淀粉糖化酶 (diastase),意思是“分離”。所以后人命名酶時常加詞尾-ase。由于他們用乙醇沉淀等方法提純得到了無細(xì)胞的酶制劑,并發(fā)現(xiàn)了酶的催化特性和熱不穩(wěn)定性,所以一般認(rèn)為他們首先發(fā)現(xiàn)了酶。

  19世紀(jì)西方對發(fā)酵現(xiàn)象的研究推動了對酶的進(jìn)一步研究。巴斯德提出“酵素”一詞,認(rèn)為只有活的酵母細(xì)胞才能進(jìn)行發(fā)酵?,F(xiàn)在日本還經(jīng)常使用“酵素”一詞(ferment)。1878年德國人庫恩(Kuhne)提出“Enzyme”一詞,意為“在酵母中”。1896年德國人巴克納 (Buchner)兄弟用石英砂磨碎酵母細(xì)胞,得到了能催化發(fā)酵的無細(xì)胞濾液,證明發(fā)酵是一種化學(xué)反應(yīng),與細(xì)胞的活力無關(guān)。這項發(fā)現(xiàn)涉及到了酶的本質(zhì),有人認(rèn)為這是酶學(xué)研究的開始。

  1913年米凱利斯(Michaelis)和門頓(Menten)利用物理化學(xué)方法提出了酶促反應(yīng)的動力學(xué)原理—米氏學(xué)說,使酶學(xué)可以定量研究。1926年美國人J. B. Sumner從刀豆中結(jié)晶出脲酶(第一個酶結(jié)晶),并提出酶是蛋白質(zhì)的觀點。后來陸續(xù)得到多種酶的結(jié)晶,證明了這種觀點,薩姆納因而獲得1947年諾貝爾獎。此后多種酶被發(fā)現(xiàn)、結(jié)晶、測定結(jié)構(gòu),并產(chǎn)生了酶工程等分支學(xué)科。

  進(jìn)入80年代后,核糖酶(ribozyme)、抗體酶、模擬酶等相繼出現(xiàn),酶的傳統(tǒng)概念受到挑戰(zhàn)。1982年Cech等發(fā)現(xiàn)四膜蟲26S rRNA前體具有自我剪接功能,并于1986年證明其內(nèi)含子L-19 IVS具有多種催化功能。此后陸續(xù)發(fā)現(xiàn)多種具有催化功能的RNA,底物也擴(kuò)大到DNA、糖類、氨基酸酯。還有人在實驗室中設(shè)計合成新的核糖酶。甚至有人發(fā)現(xiàn)博萊霉素等肽類抗生素也有催化能力。這些新發(fā)現(xiàn)不僅增加了對酶的本質(zhì)的研究,也有助于對生命起源等問題的探討,使酶學(xué)研究進(jìn)入新的階段。

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  三、酶的特性(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  酶是生物體產(chǎn)生的,有催化能力的蛋白質(zhì)。細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì),90%都有催化活性。酶是一種生物催化劑,與一般催化劑一樣,只改變反應(yīng)速度,不改變化學(xué)平衡,并在反應(yīng)前后本身不變。但酶作為生物催化劑,與一般的無機(jī)催化劑相比有以下特點:

  1.催化效率高 酶的催化效率比無機(jī)催化劑高106-1013倍。舉例來說,1mol馬肝過氧化氫酶在一定條件下可催化5×106摩爾過氧化氫分解,在同樣條件下1mol 鐵只能催化6×10-4摩爾過氧化氫分解。因此,這個酶的催化效率是鐵的1010倍。也就是說,用過氧化氫酶在1秒內(nèi)催化的反應(yīng),同樣數(shù)量的鐵需要300 年才能反應(yīng)完。

  2.專一性強 一般催化劑對底物沒有嚴(yán)格的要求,能催化多種反應(yīng),而酶只催化某一類物質(zhì)的一種反應(yīng),生成特定的產(chǎn)物。因此酶的種類也是多種多樣的。酶催化的反應(yīng)稱為酶促反應(yīng),酶促反應(yīng)的反應(yīng)物稱為底物。酶只催化某一類底物發(fā)生特定的反應(yīng),產(chǎn)生一定的產(chǎn)物,這種特性稱為酶的專一性。

  各種酶的專一性不同,包括結(jié)構(gòu)專一性和立體專一性兩大類,結(jié)構(gòu)專一性又有絕對專一性和相對專一性之分。絕對專一性指酶只催化一種底物,生成確定的產(chǎn)物。如氨基酸:tRNA連接酶,只催化一種氨基酸與其受體tRNA的連接反應(yīng)。相對專一性指酶催化一類底物或化學(xué)鍵的反應(yīng)。如醇脫氫酶可催化許多醇類的氧化反應(yīng)。還有許多酶具有立體專一性,對底物的構(gòu)型有嚴(yán)格的要求。如乳酸脫氫酶只能催化L-乳酸,不能催化D-乳酸的反應(yīng)。

  3.反應(yīng)條件溫和 酶促反應(yīng)不需要高溫高壓及強酸強堿等劇烈條件,在常溫常壓下即可完成。

  4.酶的活性受多種因素調(diào)節(jié) 無機(jī)催化劑的催化能力一般是不變的,而酶的活性則受到很多因素的影響。比如底物和產(chǎn)物的濃度、pH值以及各種激素的濃度都對酶活有較大影響。酶活的變化使酶能適應(yīng)生物體內(nèi)復(fù)雜多變的環(huán)境條件和多種多樣的生理需要。生物通過變構(gòu)、酶原活化、可逆磷酸化等方式對機(jī)體的代謝進(jìn)行調(diào)節(jié)。

  5.穩(wěn)定性差 酶是蛋白質(zhì),只能在常溫、常壓、近中性的條件下發(fā)揮作用。高溫、高壓、強酸、強堿、有機(jī)溶劑、重金屬鹽、超聲波、劇烈攪拌、甚至泡沫的表面張力等都有可能使酶變性失活。不過自然界中的酶是多種多樣的,有些酶可以在極端條件下起作用。有些細(xì)菌生活在極端條件下,如超噬熱菌可以生活在90℃以上環(huán)境中,高限為 110℃;噬冷菌最適溫度為-2℃,高于10℃不能生長;噬酸菌生活在pH1以下,噬堿菌的最適pH大于11;噬壓菌最高可耐受1035個大氣壓。這些噬極菌的胞內(nèi)酶較為正常,但胞外酶卻可以耐受極端條件的作用。有些酶在有機(jī)溶劑中可以催化在水相中無法完成的反應(yīng)。

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  四、酶的命名與分類

  1.命名(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  酶的命名法有兩種:習(xí)慣命名與系統(tǒng)命名。習(xí)慣命名以酶的底物和反應(yīng)類型命名,有時還加上酶的來源。習(xí)慣命名簡單,常用,但缺乏系統(tǒng)性,不準(zhǔn)確。 1961年國際酶學(xué)會議提出了酶的系統(tǒng)命名法。規(guī)定應(yīng)標(biāo)明酶的底物及反應(yīng)類型,兩個底物間用冒號隔開,水可省略。如乙醇脫氫酶的系統(tǒng)命名是:醇:NAD+ 氧化還原酶。

  2.分類

  按照催化反應(yīng)的類型,國際酶學(xué)委員會將酶分為六大類。在這六大類里,又各自分為若干亞類,亞類下又分小組。亞類的劃分標(biāo)準(zhǔn):氧化還原酶是電子供體類型,移換酶是被轉(zhuǎn)移基團(tuán)的形狀,水解酶是被水解的鍵的類型,裂合酶是被裂解的鍵的類型,異構(gòu)酶是異構(gòu)作用的類型,合成酶是生成的鍵的類型。

  (1)氧化還原酶 催化氧化還原反應(yīng),如葡萄糖氧化酶,各種脫氫酶等。是已發(fā)現(xiàn)的量最大的一類酶,其氧化、產(chǎn)能、解毒功能,在生產(chǎn)中的應(yīng)用僅次于水解酶。需要輔因子,可根據(jù)反應(yīng)時輔因子的光電性質(zhì)變化來測定。按系統(tǒng)命名可分為19亞類,習(xí)慣上可分為4個亞類:

  ²脫氫酶:受體為NAD或NADP,不需氧。

  ²氧化酶:以分子氧為受體,產(chǎn)物可為水或H2O2,常需黃素輔基。

  ²過氧物酶:以H2O2為受體,常以黃素、血紅素為輔基

  ²氧合酶(加氧酶):催化氧原子摻入有機(jī)分子,又稱羥化酶。按摻入氧原子個數(shù)可分為單加氧酶和雙加氧酶。

  (2)移換酶類 催化功能基團(tuán)的轉(zhuǎn)移反應(yīng),如各種轉(zhuǎn)氨酶和激酶分別催化轉(zhuǎn)移氨基和磷酸基的反應(yīng)。移換酶也叫轉(zhuǎn)移酶,多需要輔酶,但反應(yīng)不易測定。按轉(zhuǎn)移基團(tuán)性質(zhì),可分為8個亞類,較重要的有:

  ²一碳基轉(zhuǎn)移酶:轉(zhuǎn)移一碳單位,與核酸、蛋白質(zhì)甲基化有關(guān)。

  ²磷酸基轉(zhuǎn)移酶:常稱為激酶,多以ATP為供體。少數(shù)蛋白酶也稱為激酶(如腸激酶)。

  ²糖苷轉(zhuǎn)移酶:與多糖代謝密切相關(guān),如糖原磷酸化酶。

  (3)水解酶類 催化底物的水解反應(yīng),如蛋白酶、脂肪酶等。起降解作用,多位于胞外或溶酶體中。有些蛋白酶也稱為激酶??煞譃樗怩ユI(如限制性內(nèi)切酶)、糖苷鍵(如果膠酶、溶菌酶等)、肽鍵、碳氮鍵等11亞類。

  (4)裂合酶類 催化從底物上移去一個小分子而留下雙鍵的反應(yīng)或其逆反應(yīng)。包括醛縮酶、水化酶、脫羧酶等。共7個亞類。

  (5)異構(gòu)酶類 催化同分異構(gòu)體之間的相互轉(zhuǎn)化。包括消旋酶、異構(gòu)酶、變位酶等。共6個亞類。

  (6)合成酶類 催化由兩種物質(zhì)合成一種物質(zhì),必須與ATP分解相偶聯(lián)。也叫連接酶,如DNA連接酶。共5個亞類。

  3.酶的編號

  國際酶學(xué)委員會根據(jù)酶的類別,給每種酶規(guī)定了統(tǒng)一的編號。酶的編號由EC和4個用圓點隔開的數(shù)字組成。EC表示酶學(xué)委員會,第一個數(shù)字表示酶的類別,第二個數(shù)字表示酶的亞類,第三個數(shù)字表示酶的小組,第四個數(shù)字表示酶在小組中的序列號。如EC1.1.1.1表示這個酶是氧化還原酶,電子供體是醇,電子受體是NAD+,序列號是1,即乙醇脫氫酶。胰蛋白酶的編號是EC3.4.4.4,4個數(shù)字分別表示它的類型是水解酶;水解的鍵是肽鍵;是內(nèi)切酶而不是外切酶;序列號是4。多功能酶可以有多個編號。

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  五、酶的活力(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  1.定義 指酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力。

  2.單位 在特定條件下,1分鐘內(nèi)轉(zhuǎn)化1微摩爾底物所需的酶量為一個活力單位(U)。溫度規(guī)定為25度,其他條件取反應(yīng)的最適條件。

  比活:每毫克酶蛋白所具有的酶活力。單位是u/mg。比活越高則酶越純。

  轉(zhuǎn)化數(shù):每分子酶或每個酶活性中心在單位時間內(nèi)能催化的底物分子數(shù)(TN)。相當(dāng)于酶反應(yīng)的速度常數(shù)kp。也稱為催化常數(shù)(Kcat)。1/kp稱為催化周期。碳酸酐酶是已知轉(zhuǎn)換數(shù)最高的酶之一,高達(dá)36×106每分,催化周期為1.7微秒。

  3.測定 一般采用測定酶促反應(yīng)初速度的方法來測定活力,因為此時干擾因素較少,速度保持恒定。反應(yīng)速度的單位是濃度/單位時間,可用底物減少或產(chǎn)物增加的量來表示。因為產(chǎn)物濃度從無到有,變化較大,而底物往往過量,其變化不易測準(zhǔn),所以多用產(chǎn)物來測定。

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  2015年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試順利結(jié)束,2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試筆試時間預(yù)計為2016年9月10日、11日。為方便備考2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試的考生復(fù)習(xí),環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記_2016年臨床執(zhí)業(yè)醫(yī)師考試生物化學(xué)筆記精選,希望對大家備考有幫助。

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  第二節(jié) 酶的結(jié)構(gòu)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  一、酶分子的化學(xué)組成

  酶的本質(zhì)是蛋白質(zhì)。酶與其他蛋白一樣,由氨基酸構(gòu)成,具有一、二、三、四級結(jié)構(gòu)。酶也會受到某些物理、化學(xué)因素作用而發(fā)生變性,失去活力。酶分子量很大,具有膠體性質(zhì),不能透析。酶也能被蛋白酶水解。

  1.輔因子

  有些酶完全由蛋白質(zhì)構(gòu)成,屬于簡單蛋白,如脲酶、蛋白酶等;有些酶除蛋白質(zhì)外,還含有非蛋白成分,屬于結(jié)合蛋白。其中的非蛋白成分稱為輔因子 (cofactor),蛋白部分成為酶蛋白,復(fù)合物叫全酶。輔因子一般起攜帶及轉(zhuǎn)移電子或功能基團(tuán)的作用,其中與酶蛋白以共價鍵緊密結(jié)合的稱為輔基,以非共價鍵松散結(jié)合的稱為輔酶。

  在催化過程中,輔基不與酶蛋白分離,只作為酶內(nèi)載體起作用,如黃素蛋白類酶分子中的FAD、FMN輔基攜帶氫,羧化酶的生物素輔基攜帶羧基等等。輔酶則常作為酶間載體,將兩個酶促反應(yīng)連接起來,如NAD+在一個反應(yīng)中被還原成NADH,在另一個反應(yīng)中又被氧化回NAD+。它在反應(yīng)中象底物一樣,有時也稱為輔底物。

  有30%以上的酶需要金屬元素作為輔因子。有些酶的金屬離子與酶蛋白結(jié)合緊密,不易分離,稱為金屬酶;有些酶的金屬離子結(jié)合松散,稱為金屬活化酶。金屬酶的輔因子一般是過渡金屬,如鐵、鋅、銅、錳等;金屬活化酶的輔因子一般是堿金屬或堿土金屬,如鉀、鈣、鎂等。

  2.單體酶、寡聚酶和多酶體系

  由一條肽鏈構(gòu)成的酶稱為單體酶,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)由多條肽鏈以非共價鍵結(jié)合而成的酶稱為寡聚酶,屬于寡聚蛋白。有時在生物體內(nèi)一些功能相關(guān)的酶被組織起來,構(gòu)成多酶體系,依次催化有關(guān)的反應(yīng)。構(gòu)成多酶體系是代謝的需要,可以降低底物和產(chǎn)物的擴(kuò)散限制,提高總反應(yīng)的速度和效率。

  有時一條肽鏈上有多種酶活性,稱為多酶融合體。如糖原分解中的脫支酶在一條肽鏈上有淀粉-1,6-葡萄糖苷酶和4-α-D-葡聚糖轉(zhuǎn)移酶活性; 來自樟樹種子的克木毒蛋白(camphorin)由一條肽鏈組成,有三種活性:① RNA N-糖苷酶活性,可水解大鼠28S rRNA中第4324位腺苷酸的糖苷鍵,釋放一個腺嘌呤;② 依賴于超螺旋DNA構(gòu)型的核酸內(nèi)切酶活性,專一解旋并切割超螺旋環(huán)狀DNA形成缺口環(huán)狀和線狀DNA;③ 超氧化物歧化酶活性。來自紅色鏈孢霉的AROM多酶融合體是二聚體,每條肽鏈含五種酶活性,可催化莽草酸途徑的第二至第六步反應(yīng),由于有中間產(chǎn)物的傳遞通道,使催化效率大為提高。

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  二、酶的活性中心

  1.定義(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  酶是大分子,其分子量一般在一萬以上,由數(shù)百個氨基酸組成。而酶的底物一般很小,所以,直接與底物接觸并起催化作用的只是酶分子中的一小部分。有些酶的底物雖然較大,但與酶接觸的也只是一個很小的區(qū)域。因此,人們認(rèn)為,酶分子中有一個活性中心,它是酶分子的一小部分,是酶分子中與底物結(jié)合并催化反應(yīng)的場所?;钚灾行氖怯忻阜肿又猩贁?shù)幾個氨基酸殘基構(gòu)成的,它們在一級結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),甚至位于不同的肽鏈上,由于肽鏈的盤曲折疊而互相接近,構(gòu)成一個特定的活性結(jié)構(gòu)。因此活性中心不是一個點或面,而是一個小的空間區(qū)域。

  2.分類

  活性中心的氨基酸按功能可分為底物結(jié)合部位和催化部位。前者負(fù)責(zé)識別特定的底物并與之結(jié)合。它們決定了酶的底物專一性。催化部位是起催化作用的,底物的敏感鍵在此被切斷或形成新鍵,并生成產(chǎn)物。二者的分別并不是絕對的,有些基團(tuán)既有底物結(jié)合功能又有催化功能。

  Koshland將酶分子中的殘基分為四類:接觸亞基負(fù)責(zé)底物的結(jié)合與催化,輔助亞基起協(xié)助作用,結(jié)構(gòu)亞基維持酶的構(gòu)象,非貢獻(xiàn)亞基的替換對活性無影響,但對酶的免疫、運輸、調(diào)控與壽命等有作用。前二者構(gòu)成活性中心,前三者稱為酶的必須基團(tuán)。

  活性中心以外的部分并不是無用的,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)它們能夠維持酶的空間結(jié)構(gòu),使活性中心保持完整。在酶與底物結(jié)合后,整個酶分子的構(gòu)象發(fā)生變化,這種扭動的張力使底物化學(xué)鍵容易斷裂。這種變化也要依靠非活性中心的協(xié)同作用。

  一般單體酶只有一個活性中心,但有些具有多種功能的多功能酶具有多個活性中心。如大腸桿菌DNA聚合酶I是一條109kd的肽鏈,既有聚合酶活性,又有外切酶活性。

  3.形成過程

  有些酶在細(xì)胞內(nèi)剛剛合成或分泌時,尚不具有催化活性,這些無活性的酶的前體稱為酶原。酶原通過激活才能轉(zhuǎn)化為有活性的酶。酶原的激活是通過改變酶分子的共價結(jié)構(gòu)來控制酶活性的一種機(jī)制,通過肽鏈的剪切,改變蛋白的構(gòu)象,從而形成或暴露酶的活性中心,使酶原在必要時被活化成為有活性的酶,發(fā)揮其功能。

  4.研究活性中心的方法

  酶的底物和競爭性抑制劑的結(jié)構(gòu)特點有助于研究酶的活性中心的結(jié)構(gòu)。酶的最適pH及速度常數(shù)等動力學(xué)特點也可提供一些信息。

  化學(xué)修飾在活性中心的研究中起過很重要的作用。因為活性中心的基團(tuán)反應(yīng)性常與其他基團(tuán)不同,所以一些試劑可以專一性地與活性中心中的某種殘基反應(yīng),而不與活性中心外的殘基作用。如DFP(二異丙基氟磷酸)可與活性中心中的絲氨酸反應(yīng)。TPCK(N-對甲苯磺酰苯丙氨酰氯甲基酮)的專一性更強,只能與糜蛋白酶活性中心的His-57結(jié)合,稱為親和標(biāo)記。它是底物類似物,烷化劑。TLCK(賴氨酸衍生物)作用于胰酶的His-46。某些試劑的專一性不強,可用差示標(biāo)記法:先用底物類似物保護(hù)活性中心,加入修飾劑,與活性中心以外的基團(tuán)反應(yīng),然后除去抑制劑,再加入放射性標(biāo)記的試劑,此時試劑只能與活性中心的基團(tuán)反應(yīng),測定放射性的位置,即可找到活性中心。

  紫外、熒光、園二色光譜等方法也可用與活性中心的研究。在酶與底物結(jié)合時,位于底物結(jié)合部位的生色團(tuán)必然會發(fā)生某種變化,從而導(dǎo)致其光譜的變化。這些生色團(tuán)可以是酶本身帶有的,也可以人工引入。這種方法可以用來判斷活性中心的構(gòu)成,也可以研究催化的反應(yīng)過程。最直接最準(zhǔn)確的方法是X-射線衍射。

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  三、同工酶(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  同工酶是同一生物催化同一反應(yīng)的不同的酶分子。同工酶的催化作用相同,但其功能意義有所不同。不同種生物有相同功能的酶不是同工酶。同工酶具有相同或相似的活性中心,但其理化性質(zhì)和免疫學(xué)性質(zhì)不同。同工酶的細(xì)胞定位、專一性、活性及其調(diào)節(jié)可有所不同。每種同工酶都有其獨特的功能意義。如乳酸脫氫酶(LDH)是由4個亞基組成的四聚體。亞基有A(M)和B(H)兩種,有5種同工酶:LDH1(H4)、LDH2(MH3)、LDH3(M2H2)、 LDH4(M3H)、LDH5(M4)。M、H兩個亞基由不同基因編碼,在不同細(xì)胞中合成速度不同,所以在不同的組織器官中5種同工酶的比例不同,經(jīng)電泳分離后會得到不同的同工酶譜。人體心肌中LDH1和LDH2較多,而骨骼肌中LDH5較多。M亞基對丙酮酸的Km較高,且不受底物抑制,因而肌肉可生成大量乳酸;H亞基的Km小,并受底物抑制,隨底物增加很快飽和,所以心臟生成乳酸很少,此酶主要用于乳酸的氧化。臨床上通過分析病人血清LDH同工酶譜,有助于診斷病變發(fā)生的部位。如心肌損害時血清中LDH1升高;肺損害時LDH3升高。

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  第三節(jié) 酶的催化機(jī)制(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  一、酶與底物的結(jié)合

  酶與底物結(jié)合的作用力主要是氫鍵、鹽鍵和范德華力。鹽鍵是帶電荷基團(tuán)之間的靜電吸引力,疏水基團(tuán)之間的作用也稱為疏水鍵。

  酶與底物的結(jié)合是有專一性的,人們曾經(jīng)用鎖和鑰匙來比喻酶和底物的關(guān)系。這種“鎖鑰學(xué)說”是不全面的。比如,酶既能與底物結(jié)合,也能與產(chǎn)物結(jié)合,催化其逆反應(yīng)。于是又提出了“誘導(dǎo)契合學(xué)說”,認(rèn)為當(dāng)酶與底物接近時,酶蛋白受底物分子的誘導(dǎo),其構(gòu)象發(fā)生改變,變得有利于與底物的結(jié)合和催化。

  二、酶加快反應(yīng)速度的因素

  酶加快反應(yīng)速度主要靠降低反應(yīng)的活化能,即底物分子達(dá)到活化態(tài)所需的能量。例如脲酶可使尿素水解反應(yīng)的活化能由136kj/mol降到46kj/mol,使反應(yīng)速度提高1014倍。酶的催化機(jī)理主要有以下幾點:

  1.鄰近定向 對一個雙分子反應(yīng),酶可以使兩個底物結(jié)合在活性中心彼此靠近,并具有一定的取向。這比在溶液中隨機(jī)碰撞更容易反應(yīng)。對不同的反應(yīng),由分子間反應(yīng)變成分子內(nèi)反應(yīng)后,反應(yīng)速度可加快100倍到1011倍。

  2.底物形變 酶與底物結(jié)合時,不僅酶的構(gòu)象改變,底物的構(gòu)象也會發(fā)生變化。這種變化使底物更接近于過渡態(tài),因此可以降低活化能。

  3.酸堿催化和共價催化 酶活性中心的一些殘基的側(cè)鏈基團(tuán)可以起酸堿催化或共價催化的作用。酸堿催化可分為一般酸堿催化和特殊酸堿催化兩種,特殊酸堿催化是指H+和OH-的催化作用;一般酸堿催化還包括其他弱酸弱堿的催化作用。酶促反應(yīng)一般發(fā)生在近中性條件,H+和OH-的濃度很低,所以酶促反應(yīng)主要是一般酸堿催化。酶分子中的一些可解離集團(tuán)如咪唑基、羧基、氨基、巰基常起一般酸堿催化作用,其中咪唑最活潑有效。

  有些酶有酸堿共催化機(jī)制及質(zhì)子轉(zhuǎn)移通路。四甲基葡萄糖在苯中的變旋反應(yīng)如果單獨用吡啶(堿)或酚(酸)來催化,速度很慢;如果二者混合催化,則速度加快,即酸堿共催化。如果把酸和堿集中在一個分子中,即合成α-羥基吡啶,它的催化速度又加快7000倍。這是因為兩個催化集團(tuán)集中在一個分子中有利于質(zhì)子的傳遞。在酶-底物復(fù)合物中經(jīng)常由氫鍵和共軛結(jié)構(gòu)形成質(zhì)子傳遞通路,從而大大提高催化效率。

  共價催化可分為親電催化和親核催化。絲氨酸蛋白酶、含巰基的木瓜蛋白酶、以硫胺素為輔酶的丙酮酸脫羧酶都有親核催化作用。羥基、巰基和咪唑基都有親核催化作用。金屬離子和酪氨酸羥基、-NH3+都是親電基團(tuán)。共價催化經(jīng)常形成反應(yīng)活性很高的共價中間物,將一步反應(yīng)變成兩步或多步反應(yīng),繞過較高的能壘,使反應(yīng)快速進(jìn)行。(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)例如胰蛋白酶通過絲氨酸側(cè)鏈羥基形成?;?酶共價中間物,降低活化能。

  4.微環(huán)境的作用 有些酶的活性中心是一個疏水的微環(huán)境,其介電常數(shù)較低,有利于電荷之間的作用,也有利于中間物的生成和穩(wěn)定。如賴氨酸側(cè)鏈氨基的pK約為9,而在乙酰乙酸脫羧酶活性中心的賴氨酸側(cè)鏈pK只有6左右。

  以上幾點都可加速反應(yīng),但每種酶不同,可同時具有其中的幾種因素。

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  第四節(jié) 酶促反應(yīng)的動力學(xué)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  酶促反應(yīng)的動力學(xué)是研究酶促反應(yīng)的速度以及影響速度的各種因素的科學(xué)。動力學(xué)研究既可以為酶的機(jī)理研究提供實驗證據(jù),又可以指導(dǎo)酶在生產(chǎn)中的應(yīng)用,最大限度地發(fā)揮酶的催化作用。

  一、米氏方程

  1.米氏方程的推導(dǎo)

  米氏學(xué)說是1913年Michaelis和Menton建立的,認(rèn)為反應(yīng)分為兩步,先生成酶-底物復(fù)合物(中間產(chǎn)物),再分解形成產(chǎn)物,釋放出游離酶。經(jīng)過Briggs和Haldane的補充與發(fā)展,得到了現(xiàn)在的米氏方程。

  S+E=SE=P+E

  對于上面的反應(yīng),首先有三點假設(shè):第一,底物大過量,即[S]》[E]。第二,在反應(yīng)初期,產(chǎn)物濃度極小,忽略逆反應(yīng)即k-2=0;第三,穩(wěn)態(tài)假設(shè),即隨著反應(yīng)的進(jìn)行,復(fù)合物的形成速度逐漸降低,分解加快,在某一時刻達(dá)到平衡,復(fù)合物的濃度為常數(shù),這種狀態(tài)稱為“穩(wěn)態(tài)”。體系達(dá)到穩(wěn)態(tài)后,底物的消耗和產(chǎn)物的生成速度都是常數(shù),且相等。經(jīng)測定,酶加入體系后,在幾毫秒之內(nèi)即可達(dá)到穩(wěn)態(tài),所以我們測定的初速度通常是穩(wěn)態(tài)速度。在產(chǎn)物積累較多之前,體系一直保持穩(wěn)態(tài),所以反應(yīng)速度

  v=k2[ES]。根據(jù)穩(wěn)態(tài)假設(shè),有k1[E][S]=(k-1+k2)[ES],即[ES]=k1[E][S]/(k-1+k2)。定義 (k-1+k2)/k1=Km,因為[E]= [E]0-[ES],故[ES]= [E]0[S]/(Km+[S])。代入速度方程,得到v= k2[E]0[S]/(Km+[S])。因為當(dāng)[ES]=[E]0時速度最大,所以Vm=k2[E]0。代入,得到下列米氏方程:

  v=Vm×[S]/(Km+[S])

  2.米氏常數(shù)的意義

  米氏常數(shù)的物理意義是反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。其酶學(xué)意義在于,它是酶的特征常數(shù),只與酶的性質(zhì)有關(guān),與酶濃度無關(guān)。不同的酶其Km不同,同種酶對不同底物也不同。在k2極小時1/Km可近似表示酶與底物的親和力,1/Km越大,親和力越大。在酶的多種底物中,Km最小的底物叫做該酶的天然底物。

  3.米氏常數(shù)的測定

  從酶的v-[s]圖上可以得到Vm,再從1/2Vm處讀出[s],即為Km。但實際上只能無限接近Vm,卻無法達(dá)到。為得到準(zhǔn)確的米氏常數(shù),可以把米氏方程加以變形,使它相當(dāng)于線性方程,通過作圖得到準(zhǔn)確的米氏常數(shù)。

  雙倒數(shù)作圖法 將方程改寫為

  1/v=Km/Vm×1/[S]+1/Vm

  實驗時在不同的底物濃度測定初速度,以1/v對1/[S]作圖,直線外推與橫軸相交,橫軸截踞為-1/Km,縱軸截踞為1/Vm。此法稱為Lineweaver-Burk作圖法,應(yīng)用最廣,但實驗點常集中在左端,作圖不易準(zhǔn)確。

  Eadie-Hofstee法 將方程改寫為

  v=-Km×v/[S]+Vm

  以v對v/[S]作圖,直線斜率為-Km。

  4.其他動力學(xué)參數(shù)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  Kcat/Km稱為酶的專一性常數(shù),它不受非生產(chǎn)性結(jié)合與中間產(chǎn)物積累的影響,可以表示酶對相互競爭的幾種底物的專一性。生理條件下許多反應(yīng)的底物濃度是很低的。在底物濃度很低時,v=(Kcat/Km)[E][S],即Kcat/Km是表觀二級速度常數(shù)。因為Kcat /Km=k3k1/(k2+k3),所以它小于k1,即小于酶和底物復(fù)合物生成的速度常數(shù)。它不是真實的微觀速度常數(shù),只有當(dāng)反應(yīng)的限速步驟是酶與底物的相互碰撞時,它才是真實的微觀速度常數(shù)。擴(kuò)散限制決定了速度常數(shù)的上限是108-109mol-1s-1,碳酸酐酶、磷酸丙糖異構(gòu)酶、乙酰膽堿酯酶等都接近這一極限,說明他們的進(jìn)化已經(jīng)很完善。

  反應(yīng)級數(shù):對于xA+yB=p的反應(yīng),其速度v=k[A]a[B]b,對底物A是a級,對底物B是b級,整個反應(yīng)的級數(shù)是a+b級。反應(yīng)分子數(shù)是指在最慢的一步反應(yīng)中,參加的最低分子數(shù)目。它是指反應(yīng)機(jī)制,必須是整數(shù);而反應(yīng)級數(shù)是通過實驗測得的,可以是小數(shù)。根據(jù)米氏方程,當(dāng)?shù)孜餄舛冗h(yuǎn)大于米氏常數(shù)時,v=Vm,是零級反應(yīng);反之,v=(Vm/Km)[s],是一級反應(yīng)。而中間部分則是混合級反應(yīng)。

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  二、多底物反應(yīng)的機(jī)制

  許多酶催化的反應(yīng)比較復(fù)雜,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)包含一種以上底物,它們的反應(yīng)按分子數(shù)分為幾類,單分子稱為uni,雙分子稱為bi,三分子為ter,四分子為quad。較為常見的是雙底物雙產(chǎn)物反應(yīng),稱為bi-bi反應(yīng):

  A+B→P+Q

  目前認(rèn)為大部分雙底物反應(yīng)可能有三種反應(yīng)機(jī)理:

  1.依次反應(yīng)機(jī)理

  需要NAD+或NADP+的脫氫酶的反應(yīng)就屬于這種類型。輔酶作為底物A先與酶生成EA,再與底物B生成三元復(fù)合物EAB,脫氫后生成產(chǎn)物P,最后放出還原型輔酶NADH或NADPH。

  2.隨機(jī)機(jī)理

  底物的加入和產(chǎn)物的放出都是隨機(jī)的,無固定順序。如糖原磷酸化的反應(yīng)。

  3.乒乓機(jī)制

  轉(zhuǎn)氨酶是典型的乒乓機(jī)制,酶首先與底物A(氨基酸)作用,產(chǎn)生中間產(chǎn)物EA,底物中的氨基轉(zhuǎn)移到輔酶,使輔酶中的磷酸吡哆醛變成磷酸吡哆胺,即 EA轉(zhuǎn)變?yōu)镕P,然后放出產(chǎn)物P(α-酮酸),得到酶F,再與底物B(另一個酮酸)作用,放出產(chǎn)物Q(相應(yīng)的氨基酸)和酶E。由乙酰輔酶A、ATP和 HCO3-三個底物生成丙酰輔酶A的反應(yīng)也屬于乒乓機(jī)制。

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  三、影響反應(yīng)速度的因素

  (一)pH的影響 大部分酶的活力受pH值的影響,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)在一定的pH值活力最高,稱最適pH。一般酶的最適pH在6-8,少數(shù)酶需偏酸或堿性條件。如胃蛋白酶最適pH在1.5,而肝精氨酸酶在9.7。

  pH影響酶的構(gòu)象,也影響與催化有關(guān)基團(tuán)的解離狀況及底物分子的解離狀態(tài)。最適pH有時因底物種類、濃度及緩沖溶液成分不同而變化,不是完全不變的。

  大部分酶的pH-酶活曲線是鐘形曲線,但也有少數(shù)酶只有鐘形的一半,甚至是直線。如木瓜蛋白酶底物的電荷變化對催化沒有影響,在pH4-10之間是一條直線。

  (二)溫度的影響 酶活隨溫度變化的曲線是鐘形曲線,有一個最高點,即最適溫度。溫血動物的酶最適溫度是35-40度,植物酶在40-50度。這是溫度升高時化學(xué)反應(yīng)加速 (每升溫10℃反應(yīng)速度加快1-2倍)與酶失活綜合平衡的結(jié)果。一般酶在60度以上變性,少數(shù)酶可耐高溫,如牛胰核糖核酸酶加熱到100度仍不失活。干燥的酶耐受高溫,而液態(tài)酶失活快。

  最適溫度也不是固定值,它受反應(yīng)時間影響,酶可在短時間內(nèi)耐受較高溫度,時間延長則最適溫度降低。

  熱失活的活化能一般為50-100Kcal/mol,比一般反應(yīng)的活化能高10倍,在30℃以下是穩(wěn)定的。

  (三)激活劑的影響 凡是能提高酶活性的物質(zhì)都稱為激活劑。大部分激活劑是離子或簡單有機(jī)化合物。按照分子大小,可分為三類:

  1.無機(jī)離子 可分為金屬離子、氫離子和陰離子三種。起激活劑作用的金屬離子有鉀、鈉、鈣、鎂、鋅、鐵等,原子序數(shù)在11-55之間,其中鎂是多種激酶及合成酶的激活劑。陰離子的激活作用一般不明顯,較突出的是動物唾液中的α淀粉酶受氯離子激活,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)溴的激活作用稍弱。

  激活劑的作用有選擇性,對另一種酶可能起抑制作用。有些離子還有拮抗作用,如鈉抑制鉀的激活作用,鈣抑制鎂。有些金屬離子可互相替代,如激酶的鎂離子可用錳取代。激活劑的濃度也有影響,濃度過高可能起抑制作用。如對于NADP+合成酶,鎂離子濃度在5-10×10-3M時起激活作用,在 30×10-3M時酶活下降。

  2.中等大小有機(jī)分子 某些還原劑如半胱氨酸、還原型谷胱甘肽、氰化物等,能激活某些酶,打開分子中的二硫鍵,提高酶活,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)如木瓜蛋白酶、D-甘油醛-3-磷酸脫氫酶等。另一種是EDTA,可螯合金屬,解除重金屬對酶的抑制作用。

  3.蛋白質(zhì)類 指可對某些無活性的酶原起作用的酶。

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  (四)抑制劑(inhibitor)的作用

  使酶活力下降,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)但不引起酶蛋白變性的作用稱為抑制作用。能引起抑制作用的物質(zhì)叫做酶的抑制劑。抑制劑與酶分子上的某些必需基團(tuán)反應(yīng),引起酶活力下降,甚至喪失,但并不使酶變性。研究抑制作用有助于對酶的作用機(jī)理、生物代謝途徑、藥物作用機(jī)制的了解。抑制作用根據(jù)可逆性可分為兩類:可逆抑制與不可逆抑制。

  1.不可逆抑制(irreversible inhibition) 此類抑制劑通常以共價鍵與酶結(jié)合,不能用透析、超濾等方法除去。按抑制劑的選擇性,又可分為專一性與非專一性不可逆抑制劑。前者只能與活性部位的基團(tuán)反應(yīng),后者可與多種基團(tuán)反應(yīng)。如對活性部位基團(tuán)的親和力比對其他基團(tuán)大三個數(shù)量級,即為專一性抑制劑。有時因作用對象及條件不同,某些非專一性抑制劑會轉(zhuǎn)化,產(chǎn)生專一性抑制作用。常用來判斷專一性的方法有:有底物保護(hù)現(xiàn)象、有化學(xué)計量關(guān)系,且作用后酶完全失活、與失活的酶不反應(yīng)。

  常見的不可逆抑制劑有:

  ²有機(jī)磷化合物 可與酶中與酶活直接相關(guān)的絲氨酸上的羥基牢固結(jié)合,從而抑制某些蛋白酶及酯酶,是專一性抑制劑。此類化合物強烈抑制膽堿酯酶,使乙酰膽堿堆積,引起一系列神經(jīng)中毒癥狀,又稱為神經(jīng)毒劑。二戰(zhàn)中使用過的DFP及有機(jī)磷殺蟲劑都屬于此類。當(dāng)有大量底物存在時,底物先與酶的活性部位結(jié)合,抑制作用就會減弱,稱為底物保護(hù)作用。有機(jī)磷與酶結(jié)合后雖不解離,但有時可用肟化物(含-CH=NOH基)或羥肟酸把酶上的磷酸根除去,使酶恢復(fù)活性。臨床上用的解磷定 (PAM)就是此類化合物。

  ²有機(jī)砷、汞化合物 與巰基作用,抑制含巰基的酶。如對氯汞苯甲酸,可用過量巰基化合物如半胱氨酸或還原型谷胱甘肽解除。砷化物可破壞硫辛酸輔酶,從而抑制丙酮酸氧化酶系統(tǒng)。路易斯毒氣(CHCl=CHAsCl2)能抑制幾乎所有的巰基酶。砷化物的毒性不能用單巰基化合物解除,可用過量雙巰基化合物解除,如二巰基丙醇等。它是臨床上重要的砷化物及重金屬中毒的解毒劑。

  ²氰化物 與含鐵卟啉的酶(如細(xì)胞色素氧化酶)中的Fe2+結(jié)合,使酶失活而抑制細(xì)胞呼吸。

  ²重金屬 銀、銅、鉛、汞等鹽類能使大多數(shù)酶失活,可用螯合劑如EDTA解除??赡苁桥c酶分子中的巰基發(fā)生反應(yīng),或置換酶中的金屬離子。

  ²烷化劑 主要是含鹵素的化合物,如碘乙酸、碘乙酰胺、鹵乙酰苯等,是一種非專一性抑制劑,可以烷化巰基,使酶失活。常用于鑒定酶中巰基。

  ²自殺底物 以潛伏狀態(tài)存在,與某些酶的活性中心結(jié)合后被激活,產(chǎn)生抑制作用。此類抑制劑有高度專一性,只有遇到靶子酶時才轉(zhuǎn)變。也稱為Kcat型專一性不可逆抑制劑。另一類專一性不可逆抑制劑稱為Ks型,是底物類似物,如TPCK等。

  2.可逆抑制 與酶的結(jié)合是可逆的,可用透析法除去抑制劑,恢復(fù)酶活。根據(jù)抑制劑與底物的關(guān)系,可逆抑制可分為三種:

  (1)競爭性抑制 抑制劑結(jié)構(gòu)與底物類似,與酶形成可逆的EI復(fù)合物但不能分解成產(chǎn)物P。抑制劑與底物競爭活性中心,從而阻止底物與酶的結(jié)合??赏ㄟ^提高底物濃度減弱這種抑制。最典型的例子是丙二酸對琥珀酸脫氫酶的抑制。競爭性抑制劑使Km增大,Km'=Km×(1+I/Ki),Vm不變。

  競爭性抑制最常見,磺胺類藥物就是競爭性抑制劑,如對氨基苯磺胺。它與對氨基苯甲酸相似,可抑制細(xì)菌二氫葉酸合成酶,從而抑制細(xì)菌生長繁殖。人體可利用食物中的葉酸,而細(xì)菌不能利用外源的葉酸,所以對此類藥物敏感??咕鲂㏕MP可增強磺胺的藥效,因為其結(jié)構(gòu)與二氫葉酸類似,可抑制細(xì)菌二氫葉酸還原酶,但很少抑制人體二氫葉酸還原酶。(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)它與磺胺配合使用,可使細(xì)菌的四氫葉酸合成受到雙重阻礙,嚴(yán)重影響細(xì)菌的核酸及蛋白質(zhì)合成。

  植物中的某些生物堿如毒扁豆堿是膽堿酯酶的競爭性抑制劑,含季銨基團(tuán),與乙酰膽堿類似,能抑制膽堿酯酶活力。

  (2)非競爭性抑制 酶可以同時與底物和抑制劑結(jié)合,兩者沒有競爭。但形成的中間物ESI不能分解成產(chǎn)物,因此酶活降低。非競爭抑制劑與酶活性中心以外的基團(tuán)結(jié)合,大部分與巰基結(jié)合,破壞酶的構(gòu)象,如一些含金屬離子(銅、汞、銀等)的化合物。亮氨酸是精氨酸酶的非競爭抑制劑,EDTA絡(luò)合金屬引起的抑制也是非競爭抑制,如對需要鎂離子的己糖激酶的抑制。非競爭性抑制使Km不變,Vm變小。

  (3)反競爭性抑制 酶與底物結(jié)合后才能與抑制劑結(jié)合,復(fù)合物不能生成產(chǎn)物。反競爭性抑制劑使Km和Vm都變小。

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  第五節(jié) 酶的調(diào)節(jié)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  生物體通過調(diào)節(jié)酶的功能來控制代謝速度。酶的調(diào)節(jié)機(jī)制有兩類,一是對酶數(shù)量的調(diào)節(jié),另一類是對酶活性的調(diào)節(jié)。前者通過控制酶的合成與降解速度來控制酶量,作用緩慢而持久,稱粗調(diào);后者改變酶的活性,效果快速而短暫,稱細(xì)調(diào)。

  一、酶活性的調(diào)節(jié)

  (一)變構(gòu)調(diào)節(jié)

  1.定義

  有些酶在專一性的變構(gòu)效應(yīng)物的誘導(dǎo)下,結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,使催化活性改變,稱為變構(gòu)酶或別構(gòu)酶(allosteric enzyme)。使酶活增加的效應(yīng)物稱為正調(diào)節(jié)物,反之稱為負(fù)調(diào)節(jié)物。變構(gòu)酶是寡聚酶,分子中除活性中心外還有別構(gòu)中心(調(diào)節(jié)中心)。兩個中心可在同一亞基,也可在不同亞基。有活性中心的亞基稱為催化亞基,有別構(gòu)中心的亞基稱為調(diào)節(jié)亞基。別構(gòu)效應(yīng)也可擴(kuò)展到非酶蛋白,如血紅蛋白與氧結(jié)合的過程中也有別構(gòu)效應(yīng)。

  2.分類

  大部分別構(gòu)酶的v-[S]曲線呈S形,與米氏酶不同。這種曲線表明酶與一分子底物(或效應(yīng)物)分子結(jié)合后,其構(gòu)象發(fā)生改變,有利于后續(xù)分子的結(jié)合,稱為正協(xié)同效應(yīng)。這種現(xiàn)象有利于對反應(yīng)速度的調(diào)節(jié),在未達(dá)到最大反應(yīng)速度時,底物濃度的略微增加,將使反應(yīng)速度有極大提高。所以正協(xié)同效應(yīng)使酶對底物濃度的變化極為敏感。

  另一類別構(gòu)酶具有負(fù)協(xié)同效應(yīng),其動力學(xué)曲線類似雙曲線,在底物濃度較低時反應(yīng)速度變化很快,但繼續(xù)下去則速度變化緩慢(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)。所以負(fù)協(xié)同效應(yīng)使酶對底物濃度變化不敏感。

  3.判斷

  有一些沒有別構(gòu)效應(yīng)的酶也可產(chǎn)生類似的曲線,所以作圖法不能完全作為判斷別構(gòu)酶的依據(jù)??捎肦s值(saturation ratio,飽和比值)([S]90%V/[S]10%V)來定量地區(qū)分三種酶:Rs等于81為米氏酶,大于81則有正協(xié)同效應(yīng),反之為負(fù)協(xié)同。更常用的是Hill系數(shù)法,以log(v/(Vm-v))對log[S]作圖,曲線的最大斜率h稱為Hill系數(shù),米氏酶等于1,正協(xié)同酶大于1,負(fù)協(xié)同小于1。

  4.機(jī)

  齊變模型(M. W. C.):認(rèn)為酶分子中所有原子的構(gòu)象相同,無雜合狀態(tài)。在低活性的緊張態(tài)(tight,T)和高活性的松弛態(tài)(relaxed form,R)之間存在平衡,效應(yīng)物使平衡移動,從而改變酶的活性。此模型不適于負(fù)協(xié)同的酶。

  序變模型(K.N.F.):認(rèn)為各個亞基可以雜合存在,變構(gòu)是由于配體的誘導(dǎo),而不是因為平衡的移動。協(xié)同性取決于與配體結(jié)合的亞基對空位亞基的影響。此模型對兩種酶都適用。

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  5.舉例

  (1)天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶(ATCase):(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  這是嘧啶合成途徑的第一個酶,受到CTP的反饋抑制,可被ATP激活。Asp、氨甲酰磷酸均有正同促效應(yīng),CTP有異促效應(yīng),可使酶的S形程度增大,即Rs值減小,CTP之間具有正協(xié)同作用,n=3。ATP使Rs增大,當(dāng)達(dá)到飽和時即成為雙曲線。ATP和CTP都只改變酶的親和力,而不影響 Vm。琥珀酸是天冬氨酸的類似物,在天冬氨酸濃度高時是競爭性抑制劑,而當(dāng)天冬氨酸不足時則可模擬天冬氨酸的正調(diào)控變構(gòu)作用而成為激活劑。

  此酶共12個亞基,其中催化和調(diào)節(jié)亞基各6個。分子結(jié)構(gòu)為2個C3中間夾著3個R2,活性中心位于兩個催化亞基中間。別構(gòu)中心位于調(diào)節(jié)亞基的遠(yuǎn)端,通過變構(gòu)影響催化亞基的活性。

  (2)磷酸甘油醛脫氫酶GDP

  共四個亞基,Km1和Km2都較小,易與NAD+結(jié)合,即在低底物濃度時反應(yīng)較快;而Km3則增大了100倍,很難與NAD+反應(yīng)。這是由構(gòu)象變化引起的。在生物體內(nèi),當(dāng)NAD+不足時可以保證酵解的進(jìn)行,而當(dāng)過NAD+多時則供給其它反應(yīng),避免造成酸中毒。

  (二)共價調(diào)節(jié)

  這種調(diào)節(jié)是通過酶促共價修飾使其在活性形式與非活性形式之間轉(zhuǎn)變。最典型的例子是動物組織的糖原磷酸化酶,它催化糖原分解產(chǎn)生葡萄糖-1-磷酸。這個酶有兩種形式:高活性的磷酸化酶a和低活性的磷酸化酶b。前者是四個亞基的寡聚酶,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)每個亞基含有一個磷酸化的絲氨酸殘基。這些磷酸基是活性必需的,在磷酸化酶磷酸酶的作用下可水解除去,變成兩個低活性的半分子:磷酸化酶b。磷酸化酶b在磷酸化酶激酶的催化下又可以接受ATP的磷酸基變成磷酸化酶 a。

  共價調(diào)節(jié)酶可以將化學(xué)信號放大。一分子磷酸化酶激酶可以在短時間內(nèi)催化數(shù)千個磷酸化酶b,每個產(chǎn)生的磷酸化酶a又可催化產(chǎn)生數(shù)千個葡萄糖-1-磷酸,這樣就構(gòu)成了兩步的級聯(lián)放大。實際上這是腎上腺素使糖原急劇分解的更長的級聯(lián)放大的一部分。

  另一類共價調(diào)節(jié)酶是大腸桿菌谷氨酰胺合成酶等,它們接受ATP轉(zhuǎn)來的腺苷?;墓矁r修飾,或酶促脫去腺苷?;{(diào)節(jié)活性。此外,酶原的激活也是一種共價調(diào)節(jié)。

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  (三)酶原(proenzyme; zymogen)激活(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  消化道分泌的蛋白酶往往以無活性的酶原形式分泌,到達(dá)目的地時才被激活。這樣可以避免對消化腺的水解。

  胰凝乳蛋白酶原先被胰蛋白酶切割,產(chǎn)生π-胰凝乳蛋白酶,π-胰凝乳蛋白酶活性高,但不穩(wěn)定,自相切割產(chǎn)生活性較低但穩(wěn)定的α-胰凝乳蛋白酶。酶原激活后構(gòu)象發(fā)生變化,形成疏水口袋,即有活性的酶。

  胃蛋白酶原中已形成完整的活性中心,但酶原中有一段堿性序列與活性中心形成鹽橋,將活性中心堵塞。在pH5以下時,酶原可自動激活,失去44個殘基的前體片段。激活的酶還可再激活其它酶原。

  胰蛋白酶原可被腸激酶激活,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)然后激活胰凝乳蛋白酶原、胰蛋白酶原、彈性蛋白酶原及羧肽酶原。所以胰蛋白酶是胰臟蛋白酶原的共同激活劑。

  酶原激活有時會切掉很多殘基,如牛羧肽酶B激活時要從505個殘基中切掉約200個殘基。

  (四)激促蛋白和抑制蛋白

  鈣調(diào)蛋白(C AM)與鈣離子結(jié)合后可以結(jié)合到許多酶上,將其激活。視覺激動過程中的一個酶含有抑制亞基,當(dāng)這個亞基可逆釋放時,酶的活性增加。

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  二、酶含量的調(diào)節(jié)

  (一)合成速度的調(diào)節(jié)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)

  有一類酶稱為誘導(dǎo)酶,是在細(xì)胞經(jīng)特定誘導(dǎo)物誘導(dǎo)產(chǎn)生的。它的含量在誘導(dǎo)物存在下顯著增高。誘導(dǎo)物一般是其底物或類似物。其他含量基本不變的酶稱為結(jié)構(gòu)酶。誘導(dǎo)酶在微生物中較多見,如大腸桿菌的半乳糖苷酶,在培養(yǎng)基中加入乳糖,則誘導(dǎo)產(chǎn)生,使細(xì)菌能利用乳糖。

  結(jié)構(gòu)酶和誘導(dǎo)酶的區(qū)分是相對的,只是數(shù)量的區(qū)別,不是本質(zhì)的區(qū)別。酶的合成受基因和代謝物的雙重控制?;蚴切纬擅傅膬?nèi)因,但酶的形成還受代謝物的調(diào)控,誘導(dǎo)物可增加酶量,酶的產(chǎn)物也能產(chǎn)生阻遏作用,使酶的生成量大大減少。也就是說,代謝物可以控制酶的生成速度和數(shù)量。

  (二)降解的控制

  酶量還可通過加快或減慢酶分子的降解來調(diào)節(jié)(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記),如在饑餓時,肝臟中的精氨酸酶降解速度減慢,酶量增多;乙酰輔酶A羧化酶降解加快,酶量減少。

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  本 章 考 點

  本 章 名 詞 解 釋

  酶(enzyme):生物催化劑,(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是

  通過降低活化能加快反應(yīng)的速度。

  脫脯基酶蛋白(apoenzyme):酶中除去催化活性可能需要的有機(jī)或無機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。

  全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。

  酶活力單位(U,active unit):酶活力單位的量度。1961年國際酶學(xué)會議規(guī)定:1個酶活力單位是指在特定條件(25oC,其它為最適條件)下,在1min內(nèi)能轉(zhuǎn)化1μmol底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中1μmol的有關(guān)基團(tuán)的酶量。

  比活(specific activity):每分鐘每毫克酶蛋白在25oC下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)。比活是酶純度的測量。

  活化能(activation energy):將1mol反應(yīng)底物中所有分子由其態(tài)轉(zhuǎn)化為過度態(tài)所需要的能量。

  活性部位(active energy):酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基部分?;钚圆课煌ǔN挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很進(jìn)的一些氨基酸殘基組成。

  酸-堿催化(acid-base catalysis):質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。

  共價催化(covalent catalysis):一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價方式進(jìn)行的。

  靠近效應(yīng)(proximity effect):非酶促催化反應(yīng)或酶促反應(yīng)速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過度態(tài)。

  初速度(initial velocity):酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計。

  米氏方程(Michaelis-Mentent equation):表示一個酶促反應(yīng)的起始速度(υ)與底物濃度([s])關(guān)系的速度方程:υ=υmax[s]/(Km+[s])

  米氏常數(shù)(Michaelis constant):對于一個給定的反應(yīng),異至酶促反應(yīng)的起始速度(υ0)達(dá)到最大反應(yīng)速度(υmax)一半時的底物濃度。

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  催化常數(shù)(catalytic number)(Kcat):也稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。是一個動力學(xué)常數(shù),是在底物處于飽和狀態(tài)下一個酶(環(huán)球網(wǎng)校醫(yī)學(xué)考試網(wǎng)整理生物化學(xué)第五章酶類復(fù)習(xí)筆記)(或一個酶活性部位)催化一個反應(yīng)有多快的測量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(υmax/[E]total)?;蚴敲磕γ富钚圆课幻棵腌娹D(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的量(摩[爾])。

  雙倒數(shù)作圖(double-reciprocal plot):那稱為Lineweaver_Burk作圖。一個酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)(1/V)對底物度的倒數(shù)(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度的倒數(shù)。

  競爭性抑制作用(competitive inhibition):通過增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使Km增大而υmax不變。

  非競爭性抑制作用(noncompetitive inhibition): 抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶-底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km不變而υmax變小。

  反競爭性抑制作用(uncompetitive inhibition): 抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合而不與游離的酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km和υmax都變小但υmax/Km不變。

  絲氨酸蛋白酶(serine protease): 活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質(zhì)。

  酶原(zymogen):通過有限蛋白水解,能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。

  調(diào)節(jié)酶(regulatory enzyme):位于一個或多個代謝途徑內(nèi)的一個關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要而增加或降低。

  別構(gòu)酶(allosteric enzyme):活性受結(jié)合在活性部位以外的部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。

  別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(allosteric modulator):結(jié)合在別構(gòu)調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。

  齊變模式(concerted model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡單的齊變模式,由于一個底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)相在T(對底物親和性低的構(gòu)象)和R(對底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有相同的構(gòu)象,或是T構(gòu)象,或是R構(gòu)象。

  序變模式(sequential model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結(jié)合會誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和力。

  同功酶(isoenzyme isozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。

  別構(gòu)調(diào)節(jié)酶(allosteric modulator):那稱為別構(gòu)效應(yīng)物。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是是激活劑,也可以是抑制劑。

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