2017臨床執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試生物化學(xué)復(fù)習(xí)筆記第一章
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第一章 蛋白質(zhì)的化學(xué)
第一節(jié) 蛋白質(zhì)的分子組成
一、蛋白質(zhì)的元素組成
經(jīng)元素分析,主要有 C(50%~55%)、H(6%~7%)、O(19%~24%)、N(13%~19%)、S(0%~4%)。有些蛋白質(zhì)還含微量的P、Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo、I等。
各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。因此,可以用定氮法來推算樣品中蛋白質(zhì)的大致含量。
每克樣品含氮克數(shù)×6.25×100=100g樣品中蛋白質(zhì)含量(g%)
二、蛋白質(zhì)的基本組成單位——氨基酸
蛋白質(zhì)在酸、堿或蛋白酶的作用下,最終水解為游離氨基酸(amino acid),即蛋白質(zhì)組成單體或構(gòu)件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余種,但合成蛋白質(zhì)的氨基酸僅20種(稱編碼氨基酸),最先發(fā)現(xiàn)的是天門冬氨酸(1806年),最后鑒定的是蘇氨酸(1938年)。
(一)氨基酸的結(jié)構(gòu)通式
組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸有共同的結(jié)構(gòu)特點:
1.氨基連接在α- C上,屬于α-氨基酸(脯氨酸為α-亞氨基酸)。
2.R是側(cè)鏈,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型兩種立體異構(gòu)體。天然蛋白質(zhì)中的氨基酸都是L-型。
注意:構(gòu)型是指分子中各原子的特定空間排布,其變化要求共價鍵的斷裂和重新形成。旋光性是異構(gòu)體的光學(xué)活性,是使偏振光平面向左或向右旋轉(zhuǎn)的性質(zhì),(-)表示左旋,(+)表示右旋。構(gòu)型與旋光性沒有直接對應(yīng)關(guān)系。
(二)氨基酸的分類
1.按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)分為脂肪族、芳香族、雜環(huán)、雜環(huán)亞氨基酸四類。
2.按R基的極性和在中性溶液的解離狀態(tài)分為非極性氨基酸、極性不帶電荷、極性帶負(fù)電荷或帶正電荷的四類。
帶有非極性R(烴基、甲硫基、吲哚環(huán)等,共9種):甘(Gly)、丙(Ala)、纈(Val)、亮(Leu)、異亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp)
帶有不可解離的極性R(羥基、巰基、酰胺基等,共6種):絲(Ser)、蘇(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)
帶有可解離的極性R基(共5種):天(Asp)、谷(Glu)、賴(Lys)、精(Arg)、組(His),前兩個為酸性氨基酸,后三個是堿性氨基酸。
蛋白質(zhì)分子中的胱氨酸是兩個半胱氨酸脫氫后以二硫鍵結(jié)合而成,膠原蛋白中的羥脯氨酸、羥賴氨酸,凝血酶原中的羧基谷氨酸是蛋白質(zhì)加工修飾而成。
(三)氨基酸的重要理化性質(zhì)
1.一般物理性質(zhì)
α-氨基酸為無色晶體,熔點一般在200 oC以上。各種氨基酸在水中的溶解度差別很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀堿,但不能溶解于有機溶劑,通常酒精能把氨基酸從其溶液中沉淀析出。
芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共軛雙鍵,在近紫外區(qū)有光吸收能力,Tyr、Trp的吸收峰在280nm,Phe在265 nm。由于大多數(shù)蛋白質(zhì)含Tyr、Trp殘基,所以測定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡便的方法。
2.兩性解離和等電點(isoelectric point, pI)
氨基酸在水溶液或晶體狀態(tài)時以兩性離子的形式存在,既可作為酸(質(zhì)子供體),又可作為堿(質(zhì)子受體)起作用,是兩性電解質(zhì),其解離度與溶液的pH有關(guān)。
在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢和程度相等,成為兼性離子,呈電中性,此時溶液的pH稱為該氨基酸的等電點。氨基酸的pI是由α-羧基和α-氨基的解離常數(shù)的負(fù)對數(shù)pK1和pK2決定的。計算公式為:pI=1/2(pK1+ pK2)。
若1個氨基酸有3個可解離基團,寫出它們電離式后取兼性離子兩邊的pK值的平均值,即為此氨基酸的等電點(酸性氨基酸的等電點取兩羧基的pK值的平均值,堿性氨基酸的等電點取兩氨基的pK值的平均值)。
3.氨基酸的化學(xué)反應(yīng)
氨基酸的化學(xué)反應(yīng)是其基團的特征性反應(yīng)。重要的有:
(1)茚三酮反應(yīng)
所有具有自由α-氨基的氨基酸與過量茚三酮共熱形成藍(lán)紫色化合物(脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色物質(zhì))。用分光光度法可定量測定微量的氨基酸。藍(lán)紫色化合物的最大吸收峰在570nm波長處,黃色在440nm波長下測定。吸收峰值的大小與氨基酸釋放的氨量成正比。
(2)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)
在弱堿性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易與DNFB作用生成穩(wěn)定的黃色2,4-二硝基苯氨基酸(DNP-氨基酸),這一反應(yīng)在蛋白質(zhì)化學(xué)的研究史上起過重要作用,Sanger等人應(yīng)用它測定胰島素一級結(jié)構(gòu)。
多肽順序自動分析儀是根據(jù)相類似的原理設(shè)計的,即利用多肽鏈N端氨基酸的α-氨基與異硫氰酸苯酯PITC反應(yīng)(Edman降解法)。
三、肽(peptide)
1.肽鍵與肽鏈
一個氨基酸的α-羧基和另一個氨基酸的α-氨基脫水形成的酰胺鍵稱為肽鍵。由氨基酸通過肽鍵相連而成的化合物稱為肽。肽鍵及其兩端的α-碳原子相連所形成的長鏈骨架,即…Cα—C—N—Cα—C—N—Cα—C—N—Cα…稱為多肽主鏈,—CαCN—是重復(fù)單位。肽鍵是蛋白質(zhì)分子中的主要共價鍵。多肽鏈的方向性是從N末端指向C末端。
肽分子中不完整的氨基酸稱為氨基酸殘基。肽按其序列從N端到C端命名。一般10肽以下屬寡肽,10肽以上為多肽。
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2.生物活性肽
(1)谷胱甘肽(glutathione,GSH)
是由Glu、Cys、Gly組成的一種三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸(含γ-肽鍵)。Cys的-SH是主要功能基團,GSH是一種抗氧化劑,是某些酶的輔酶,可保護蛋白質(zhì)分子中的-SH免遭氧化,保護巰基蛋白和酶的活性。在GSH過氧化物酶的作用下,GSH還原細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生的H2O2,生成H2O,2分子GSH被氧化成GSSG,后者在GSH還原酶催化下,又生成GSH。
(2)多肽類激素和神經(jīng)肽
人體內(nèi)有許多激素屬寡肽或多肽,如下丘腦—垂體分泌的催產(chǎn)素(9肽)、加壓素(9肽)、促腎上腺皮質(zhì)激素(ACTH,39肽)等。催產(chǎn)素和加壓素結(jié)構(gòu)僅第3、第8位兩個氨基酸殘基不同,前者使平滑肌收縮,有催產(chǎn)和使乳腺泌乳的作用;后者能使小動脈收縮,增高血壓,也有減少排尿的作用。
神經(jīng)肽是在神經(jīng)傳導(dǎo)過程中起信號轉(zhuǎn)導(dǎo)作用的肽類。如腦啡肽(5肽)、β-內(nèi)啡肽(31肽)、強啡肽(17肽)等。隨著腦科學(xué)的發(fā)展,會發(fā)現(xiàn)更多的生物活性肽。
第二節(jié) 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
蛋白質(zhì)是生物大分子,結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜,人們用4個層次來描述,包括蛋白質(zhì)的一級、二級、三級和四級結(jié)構(gòu)。一級結(jié)構(gòu)描述的是蛋白質(zhì)的線性(或一維)結(jié)構(gòu),即共價連接的氨基酸殘基的序列,又稱初級或化學(xué)結(jié)構(gòu)。二級以上的結(jié)構(gòu)稱高級結(jié)構(gòu)或構(gòu)象(conformation)。
一、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)(primary structure)
1953年,英國科學(xué)家F. Sanger首先測定了胰島素(insulin)的一級結(jié)構(gòu),有51個氨基酸殘基,由一條A鏈和一條B鏈組成,分子中共有3個二硫鍵,其中兩個在A、B鏈之間,另一個在A鏈內(nèi)。
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)測定或稱序列分析常用的方法是Edman降解和重組DNA法。Edman降解是經(jīng)典的化學(xué)方法,比較復(fù)雜。首先要純化一定量的待測蛋白質(zhì),分別作分子量測定、氨基酸組成分析、N-末端分析、C-末端分析;要應(yīng)用不同的化學(xué)試劑或特異的蛋白內(nèi)切酶水解將蛋白質(zhì)裂解成大小不同的肽段,測出它們的序列,對照不同水解制成的兩套肽段,找出重疊片段,最后推斷蛋白質(zhì)的完整序列。重組DNA法是基于分子克隆的分子生物學(xué)方法,比較簡單而高效,不必先純化該種蛋白質(zhì),而是先要得到編碼該種蛋白質(zhì)的基因(DNA片段),測定DNA中核苷酸的序列,再按三個核苷酸編碼一個氨基酸的原則推測蛋白質(zhì)的完整序列。這兩種方法可以相互印證和補充。
目前,國際互聯(lián)網(wǎng)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫已有3千多種一級結(jié)構(gòu)清楚。蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)是空間結(jié)構(gòu)和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。
二、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)(secondary structure)
蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指其分子中主鏈原子的局部空間排列,是主鏈構(gòu)象(不包括側(cè)鏈R基團)。
構(gòu)象是分子中原子的空間排列,但這些原子的排列取決于它們繞鍵的旋轉(zhuǎn),構(gòu)象不同于構(gòu)型,一個蛋白質(zhì)的構(gòu)象在不破壞共價鍵情況下是可以改變的。但是蛋白質(zhì)中任一氨基酸殘基的實際構(gòu)象自由度是非常有限的,在生理條件下,每種蛋白質(zhì)似乎是呈現(xiàn)出稱為天然構(gòu)象的單一穩(wěn)定形狀。
20世紀(jì)30年代末,L.Panling 和R.B.Corey應(yīng)用X射線衍射分析測定了一些氨基酸和寡肽的晶體結(jié)構(gòu),獲得了一組標(biāo)準(zhǔn)鍵長和鍵角,提出了肽單元(peptide unit)的概念, 還提出了兩種主鏈原子的局部空間排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折疊)。
1.肽單位
肽鍵及其兩端的α-C共6個原子處于同一平面上,組成了肽單位(所在的平面稱肽鍵平面)。
肽鍵C—N鍵長為0.132nm,比相鄰的單鍵(0.147nm)短,而較C=N雙鍵(0.128nm)長,有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。肽鍵平面上各原子呈順反異構(gòu)關(guān)系,肽鍵平面上的O、H以及2個α-碳原子為反式構(gòu)型(trans configuration)。
主鏈中的Cα—C和Cα—N單鍵可以旋轉(zhuǎn),其旋轉(zhuǎn)角φ、ψ決定了兩個相鄰的肽鍵平面相對關(guān)系。由于肽鍵平面的相對旋轉(zhuǎn),使主鏈可以以非常多的構(gòu)象出現(xiàn)。事實上,肽鏈在構(gòu)象上受到很大限制,因為主鏈上有1/3不能自由旋轉(zhuǎn)的肽鍵,另外主鏈上有很多側(cè)鏈R的影響。蛋白質(zhì)的主鏈骨架由許多肽鍵平面連接而成。
2.α-螺旋(α-helix)
α-螺旋是肽鍵平面通過α-碳原子的相對旋轉(zhuǎn)形成的一種緊密螺旋盤繞,是有周期的一種主鏈構(gòu)象。其特點是:
?、?螺旋每轉(zhuǎn)一圈上升3.6個氨基酸殘基,螺距約0.54nm(每個殘基上升0.15nm,旋轉(zhuǎn)100O)。
② 相鄰的螺圈之間形成鏈內(nèi)氫鍵,氫鍵的取向幾乎與中心軸平行。典型α-螺旋一對氫鍵O與N之間共有13個原子(3.613),前后間隔3個殘基。
③螺旋的走向絕大部分是右手螺旋,殘基側(cè)鏈伸向外側(cè)。R基團的大小、荷電狀態(tài)及形狀均對α-螺旋的形成及穩(wěn)定有影響。
3.β-折疊(β-pleated sheet)
β-折疊是一種肽鏈相當(dāng)伸展的周期性結(jié)構(gòu)。
?、?相鄰肽鍵平面間折疊成110O角,呈鋸齒狀。
?、?兩個以上具β-折疊的肽鏈或同一肽鏈內(nèi)不同肽段相互平行排列,形成β-折疊片層,其穩(wěn)定因素是肽鏈間的氫鍵。
?、?逆向平行的片層結(jié)構(gòu)比順向平行的穩(wěn)定。
α-螺旋和β-折疊是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式。毛發(fā)中的α-角蛋白和蠶絲中的絲心蛋白是其典型,在許多球蛋白中也存在,但所占比例不一樣。
膠原蛋白中存在的螺旋結(jié)構(gòu)不同于一般的α-螺旋,是由3條具有左手螺旋的鏈相互纏繞形成右手超螺旋分子。鏈間氫鍵以及螺旋和超螺旋的反向盤繞維持其穩(wěn)定性。
4.β-轉(zhuǎn)角(β-turn)
為了緊緊折疊成球蛋白的緊密形狀,多肽鏈180O回折成發(fā)夾或β-轉(zhuǎn)角。其處由4個連續(xù)的氨基酸殘基構(gòu)成,常有Gly和Pro存在,穩(wěn)定β-轉(zhuǎn)角的作用力是第一個氨基酸殘基羰基氧(O)與第四個氨基酸殘基的氨基氫(H)之間形成的氫鍵。β-轉(zhuǎn)角常見于連接反平行β-折疊片的端頭。
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5.無規(guī)卷曲(random coil)
多肽鏈的主鏈呈現(xiàn)無確定規(guī)律的卷曲。典型球蛋白大約一半多肽鏈?zhǔn)沁@樣的構(gòu)象。
6.超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域
超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域是蛋白質(zhì)二級至三級結(jié)構(gòu)層次的一種過渡態(tài)構(gòu)象。
超二級結(jié)構(gòu)指蛋白質(zhì)中兩個或三個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段在空間上相互接近,形成一特殊的組合體,又稱為模體(motif)。通常有αα,ββ,βαβ等,例如鈣結(jié)合蛋白質(zhì)中的螺旋-環(huán)-螺旋模序及鋅指結(jié)構(gòu)。
結(jié)構(gòu)域是球狀蛋白質(zhì)的折疊單位,是在超二級結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進一步繞曲折疊有獨特構(gòu)象和部分生物學(xué)功能的結(jié)構(gòu)。對于較小的蛋白質(zhì)分子或亞基,結(jié)構(gòu)域和三級結(jié)構(gòu)是一個意思,即這些蛋白質(zhì)是單結(jié)構(gòu)域的;對于較大的蛋白質(zhì)分子或亞基,多肽鏈往往由兩個或兩個以上的相對獨立的結(jié)構(gòu)域締合成三級結(jié)構(gòu)。
三、蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)(tertiary structure)
指一條多肽鏈中所有原子的整體排布,包括主鏈和側(cè)鏈。維系三級結(jié)構(gòu)的作用力主要是次級鍵(疏水相互作用、靜電力、氫鍵等)。在序列中相隔較遠(yuǎn)的氨基酸疏水側(cè)鏈相互靠近,形成“洞穴”或“口袋”狀結(jié)構(gòu),結(jié)合蛋白質(zhì)的輔基往往鑲嵌其內(nèi),形成功能活性部位,而親水基團則在外,這也是球狀蛋白質(zhì)易溶于水的原因。1963年Kendrew等從鯨肌紅蛋白的X射線衍射圖譜測定它的三級結(jié)構(gòu)(153個氨基酸殘基和一個血紅素輔基,相對分子質(zhì)量為17800)。由A→H 8段α-螺旋盤繞折疊成球狀,氨基酸殘基上的疏水側(cè)鏈大都在分子內(nèi)部形成一個袋形空穴,血紅素居于其中,富有極性及電荷的則在分子表面形成親水的球狀蛋白。
四、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) (quaternary structure)
有些蛋白質(zhì)的分子量很大,由2條或2條以上具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈通過非共價鍵相互結(jié)合而成,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。構(gòu)成四級結(jié)構(gòu)的每條多肽鏈稱為亞基 (subunit),亞基單獨存在時一般沒有生物學(xué)功能,構(gòu)成四級結(jié)構(gòu)的幾個亞基可以相同或不同。如血紅蛋白(hemoglobin,Hb) 是由兩個α-亞基和兩個β-亞基形成的四聚體(α2β2)。
五、蛋白質(zhì)分子中的化學(xué)鍵
蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由共價鍵形成的,如肽鍵和二硫鍵。而維持空間構(gòu)象穩(wěn)定的是非共價的次級鍵。如氫鍵、鹽鍵、疏水鍵、范德華引力等。
第三節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
一、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
(一)一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)
20世紀(jì)60年代初,美國科學(xué)家C.Anfinsen進行牛胰核糖核酸酶的變性和復(fù)性實驗,提出了蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)決定空間結(jié)構(gòu)的命題。
核糖核酸酶由124個氨基酸殘基組成,有4對二硫鍵。用尿素和β-巰基乙醇處理該酶溶液,分別破壞次級鍵和二硫鍵,肽鏈完全伸展,變性的酶失去催化活性;當(dāng)用透析方法去除變性劑后,酶活性幾乎完全恢復(fù),理化性質(zhì)也與天然的酶一樣。
概率計算表明,8個半胱氨酸殘基結(jié)合成4對二硫鍵,可隨機組合成105種配對方式,而事實上只形成了天然酶的構(gòu)象,這說明一級結(jié)構(gòu)未破壞,保持了氨基酸的排列順序就可能回復(fù)到原來的三級結(jié)構(gòu),功能依然存在。
(二)種屬差異
大量實驗結(jié)果證明,一級結(jié)構(gòu)相似的多肽或蛋白質(zhì),其空間結(jié)構(gòu)和功能也相似,不同種屬的同源蛋白質(zhì)有同源序列,反映其共同進化起源,通過比較可以揭示進化關(guān)系。
例如哺乳動物的胰島素,其一級結(jié)構(gòu)僅個別氨基酸差異(A鏈5、6、10位,B鏈30位),它們對生物活性調(diào)節(jié)糖代謝的生理功能不起決定作用。
從各種生物的細(xì)胞色素C(cytochrome c ) 的一級結(jié)構(gòu)分析,可以了解物種進化間的關(guān)系。進化中越接近的生物,它們的細(xì)胞色素c的一級結(jié)構(gòu)越近似。
(三)分子病
分子病是指機體DNA分子上基因缺陷引起mRNA分子異常和蛋白質(zhì)生物合成的異常,進而導(dǎo)致機體某些功能和結(jié)構(gòu)隨之變異的遺傳病。在1904年,發(fā)現(xiàn)鐮刀狀紅細(xì)胞貧血病。大約化費了40多年才清楚患病原因,患者的血紅蛋白(HbS)與正常人的(HbA)相比,僅β-鏈的第6位上,Val取代了正常的Glu。目前全世界已發(fā)現(xiàn)有異常血紅蛋白400種以上。
二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)是其生物活性的基礎(chǔ),空間結(jié)構(gòu)變化,其功能也隨之改變。肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)是典型的例子。
肌紅蛋白(Mb)和血紅蛋白(Hb)都能與氧進行可逆的結(jié)合,氧結(jié)合在血紅素輔基上。然而Hb是四聚體分子,可以轉(zhuǎn)運氧;Mb是單體,可以儲存氧,并且可以使氧在肌肉內(nèi)很容易地擴散。它們的氧合曲線不同,Mb為一條雙曲線,Hb是一條 S型曲線。在低p(O2)下,肌紅蛋白比血紅蛋白對氧親和性高很多,p(O2)為2.8torr(1torr≈133.3Pa)時,肌紅蛋白處于半飽和狀態(tài)。在高p(O2)下,如在肺部(大約100torr)時,兩者幾乎都被飽和。其差異形成一個有效的將氧從肺轉(zhuǎn)運到肌肉的氧轉(zhuǎn)運系統(tǒng)。
Hb未與氧結(jié)合時,其亞基處于一種空間結(jié)構(gòu)緊密的構(gòu)象(緊張態(tài),T型),與氧的親和力小。只要有一個亞基與氧結(jié)合,就能使4個亞基間的鹽鍵斷裂,變成松弛的構(gòu)象(松弛態(tài),R型)。T型和R型的相互轉(zhuǎn)換對調(diào)節(jié)Hb運氧的功能有重要作用。一個亞基與其配體結(jié)合后能促進另一亞基與配體的結(jié)合是正協(xié)同效應(yīng),其理論解釋是Hb是別構(gòu)蛋白,有別構(gòu)效應(yīng)。
第四節(jié) 蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)
蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和氨基酸相似,有兩性解離及等電點、紫外吸收和呈色反應(yīng)。作為生物大分子,還有膠體性質(zhì)、沉淀、變性和凝固等特點。要了解和分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系就要利用其特殊的理化性質(zhì),采取鹽析、透析、電泳、層析及離心等不損傷蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的物理方法分離純化蛋白質(zhì)。
一、蛋白質(zhì)的高分子性質(zhì)
蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量在1萬~100萬,其顆粒平均直徑約為4.3 nm(膠粒范圍是1~100nm)。準(zhǔn)確可靠的測定方法是超離心法,蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量可用沉降系數(shù)(S)表示。
在球狀蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)形成時,親水基團位于分子表面,在水溶液中與水起水合作用,因此,蛋白質(zhì)的水溶液具有親水膠體的性質(zhì)。顆粒表面的水化膜和電荷是其穩(wěn)定的因素,調(diào)節(jié)pH至pI、加入脫水劑等,蛋白質(zhì)即可從溶液中沉淀出來。
透析法是利用蛋白質(zhì)不能透過半透膜的性質(zhì),去掉小分子物質(zhì),達到純化的目的。
大小不同的蛋白質(zhì)分子可以通過凝膠過濾分開。又稱分子篩層析。
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二、蛋白質(zhì)的兩性解離
蛋白質(zhì)和氨基酸一樣是兩性電解質(zhì),在溶液中的荷電狀態(tài)受pH值影響。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為該蛋白質(zhì)的等電點。pH>pI時,該蛋白質(zhì)顆粒帶負(fù)電荷,反之則帶正電荷。在人體體液中多數(shù)蛋白質(zhì)的等電點接近pH5,所以在生理pH7.4環(huán)境下,多數(shù)蛋白質(zhì)解離成陰離子。少量蛋白質(zhì),如魚精蛋白、組蛋白的pI偏于堿性,稱堿性蛋白質(zhì),而胃蛋白酶和絲蛋白為酸性蛋白。
三、蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固
蛋白質(zhì)在某些理化因素的作用下,空間結(jié)構(gòu)被破壞,導(dǎo)致理化性質(zhì)改變,生物學(xué)活性喪失,稱為蛋白質(zhì)的變性(denaturation)。
蛋白質(zhì)變性的本質(zhì)是多肽鏈從卷曲到伸展的過程,不涉及一級結(jié)構(gòu)的改變(如加熱破壞氫鍵,酸堿破壞鹽鍵等)。變性作用不過于劇烈,是一種可逆反應(yīng),去除變性因素,有些蛋白質(zhì)原有的構(gòu)象和功能可恢復(fù)或部分恢復(fù),稱為復(fù)性(denaturation)。
蛋白質(zhì)變性的主要表現(xiàn)是失去生物學(xué)活性,如酶失去催化能力、血紅蛋白失去運輸氧的功能、胰島素失去調(diào)節(jié)血糖的生理功能等。變性蛋白溶解度降低,易形成沉淀析出;易被蛋白水解酶消化。蛋白質(zhì)變性具有重要的實際意義。
蛋白質(zhì)自溶液中析出的現(xiàn)象,稱為蛋白質(zhì)的沉淀。鹽析、有機溶劑、重金屬鹽、生物堿試劑都可沉淀蛋白質(zhì)。鹽析沉淀蛋白質(zhì)不變性,是分離制備蛋白質(zhì)的常用方法。如血漿中的清蛋白在飽和的硫酸銨溶液中可沉淀,而球蛋白則在半飽和硫酸銨溶液中發(fā)生沉淀。乙醇、丙酮均為脫水劑,可破壞水化膜,降低水的介電常數(shù),使蛋白質(zhì)的解離程度降低,表面電荷減少,從而使蛋白質(zhì)沉淀析出。低溫時,用丙酮沉淀蛋白質(zhì),可保留原有的生物學(xué)活性。但用乙醇,時間較長則會導(dǎo)致變性。重金屬鹽(Hg2+、Cu2+、Ag+),生物堿(如三彔乙酸、苦味酸、鞣酸)與蛋白質(zhì)結(jié)合成鹽而沉淀,是不可逆的。
蛋白質(zhì)變性不一定沉淀(如強酸、強堿作用變性后仍然能溶解于強酸、強堿溶液中,將pH調(diào)至等電點,出現(xiàn)絮狀物,仍可溶解于強酸、強堿溶液,加熱則變成凝塊,不再溶解)。凝固是蛋白質(zhì)變性發(fā)展的不可逆的結(jié)果。沉淀的蛋白質(zhì)不一定變性(如鹽析)。
四、蛋白質(zhì)的紫外吸收和呈色反應(yīng)
蛋白質(zhì)含芳香族氨基酸,在280nm波長處有特征性吸收峰,用于定量測定。
蛋白質(zhì)分子中的多種化學(xué)基團具有特定的化學(xué)性能,與某些試劑產(chǎn)生顏色反應(yīng),可用于定性、定量分析。如蛋白質(zhì)分子中含有許多和雙縮脲結(jié)構(gòu)相似的肽鍵,在堿性溶液與硫酸銅反應(yīng)產(chǎn)生紅紫色絡(luò)合物(雙縮脲反應(yīng))。酪氨酸含酚基,與米倫試劑生成白色沉淀,加熱后變紅色。Folin-酚試劑與酪氨酸反應(yīng)生成藍(lán)色。色氨酸與乙醛酸反應(yīng),慢慢注入濃硫酸,出現(xiàn)紫色環(huán)。
第五節(jié) 蛋白質(zhì)的分類
自然界蛋白質(zhì)分布廣泛,種類繁多,有1012~1013種。目前仍無法按蛋白質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)進行精確的分類,一般按蛋白質(zhì)的分子形狀、分子組成、生物功能進行分類。
1.按分子形狀分為球狀蛋白質(zhì)和纖維狀蛋白質(zhì)。
2.按分子組成分為簡單蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì)。
簡單蛋白質(zhì)完全水解的產(chǎn)物僅為α-氨基酸。這類蛋白質(zhì)按其溶解度等理化性質(zhì)分為7類。包括清蛋白、球蛋白、醇溶蛋白、谷蛋白、精蛋白、組蛋白和硬蛋白。
結(jié)合蛋白質(zhì)由簡單蛋白質(zhì)和非蛋白質(zhì)(輔基)組成。根據(jù)輔基的不同,這類蛋白質(zhì)可分為5類。如核蛋白、糖蛋白、脂蛋白、色蛋白和磷蛋白。
細(xì)胞核中的核蛋白是DNA與組蛋白結(jié)合而成,細(xì)胞質(zhì)中的核糖體是RNA與蛋白質(zhì)組成的,已知的病毒也是核蛋白。免疫球蛋白是一類糖蛋白,由蛋白質(zhì)與糖以共價鍵相連而成;脂蛋白由蛋白質(zhì)與脂類通過非共價鍵相連,存在生物膜和動物血漿中。
3.按蛋白質(zhì)功能分為活性蛋白質(zhì)和非活性蛋白質(zhì)。
活性蛋白質(zhì)包括有催化功能的酶、有調(diào)節(jié)功能的激素、有運動、防御、接受和傳遞信息的蛋白質(zhì)以及毒蛋白、膜蛋白等。膠原、角蛋白、彈性蛋白、絲心蛋白等是非活性蛋白質(zhì)。
例題:
1、在寡聚蛋白質(zhì)中,亞基間的立體排布、相互作用以及接觸部位間的空間結(jié)構(gòu)稱之謂( )
A、三級結(jié)構(gòu) B、締合現(xiàn)象 C、四級結(jié)構(gòu) D、變構(gòu)現(xiàn)象
2、形成穩(wěn)定的肽鏈空間結(jié)構(gòu),非常重要的一點是肽鍵中的四個原子以及和它相鄰的兩個α-碳原子處于( )
A、不斷繞動狀態(tài) B、可以相對自由旋轉(zhuǎn) C、同一平面 D、隨不同外界環(huán)境而變化的狀態(tài)
3、破壞α-螺旋結(jié)構(gòu)的氨基酸殘基之一是:( )
A、亮氨酸 B、丙氨酸 C、脯氨酸 D、谷氨酸
4、肽鏈中的肽鍵大都是:( )
A、順式結(jié)構(gòu) B、順式和反式共存 C、反式結(jié)構(gòu)
參考答案
1. C 2.C 3.C 4.C
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