2013年初級(jí)檢驗(yàn)技師生化檢驗(yàn):蛋白質(zhì)組及分析技術(shù)
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隨著大量生物體全基因組序列的獲得,特別是人類(lèi)基因組序列草圖的完成,基因組學(xué)研究重點(diǎn)不可避免地從結(jié)構(gòu)基因組學(xué)轉(zhuǎn)向功能基因組學(xué),而蛋白質(zhì)組學(xué)(proteom)正是作為功能基因組研究的重要支柱在上世紀(jì)90年代中期應(yīng)運(yùn)而生。蛋白質(zhì)組是指一個(gè)基因,一個(gè)細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)成分。蛋白質(zhì)組學(xué)研究的是在不同時(shí)間和空間發(fā)揮功能的特定蛋白質(zhì)群體,從而揭示和說(shuō)明生命活動(dòng)的基本規(guī)律。蛋白質(zhì)組學(xué)可以分為三個(gè)領(lǐng)域:①蛋白質(zhì)的大規(guī)模的分離與鑒定,以及它們的表達(dá)后修飾;②蛋白水平的差異顯示在疾病中的運(yùn)用;③運(yùn)用當(dāng)前的一切手段研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互關(guān)系。與基因組相比蛋白質(zhì)組具有多樣性和可變性。對(duì)一個(gè)機(jī)體而言,基因的數(shù)目是恒定的,而蛋白質(zhì)的種類(lèi)和數(shù)目在同一個(gè)機(jī)體的不同細(xì)胞中各不相同,即使同一細(xì)胞在不同的時(shí)期,不同條件下,其蛋白質(zhì)表達(dá)也不同。雖然可以通過(guò)cDNA芯片等方法顯示生物體的基因啟動(dòng)狀況,但mRNA水平 (包括mRNA的種類(lèi)和含量 )并不能完全反映出蛋白質(zhì)的表達(dá)。另外從研究手段方面來(lái)說(shuō),蛋白質(zhì)研究技術(shù)比基因技術(shù)相對(duì)要復(fù)雜和困難,不僅氨基酸殘基數(shù)量多于核甘酸殘基,而且在蛋白質(zhì)組研究中沒(méi)有一種方法象PCR那樣能迅速擴(kuò)增目的片段,這樣對(duì)于豐度低但功能重要的蛋白質(zhì)很難進(jìn)行大規(guī)模的研究。
目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)包括:雙向(二維)聚丙烯酰胺凝膠電泳(結(jié)合等電聚焦和IEJK)分離蛋白質(zhì),在固相載體上形成蛋白質(zhì)-多肽圖譜,用敏感的方法染色(如銀染)并用圖像分析電子計(jì)算機(jī)進(jìn)行鑒定;將蛋白質(zhì)點(diǎn)切下,用酶消化,進(jìn)一步用氨基酸分析、質(zhì)譜分析等進(jìn)行鑒定;或結(jié)合蛋白質(zhì)的毛細(xì)管電泳,高效液相色譜技術(shù)(HPLC)以至蛋白質(zhì)芯片進(jìn)行鑒定。
蛋白質(zhì)芯片 (protein array)是近年來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中興起的一種新的方法,它類(lèi)似于基因芯片,是將蛋白質(zhì)點(diǎn)到固相物質(zhì)上,然后與要檢測(cè)的組織或細(xì)胞等進(jìn)行“雜交”,再通過(guò)自動(dòng)化儀器分析得出結(jié)果。這里所指的“雜交”是指蛋白與蛋白之間如 (抗體與抗原 )在空間構(gòu)象上能特異性的相互識(shí)別。此方法與傳統(tǒng)的研究方法相比具有如下優(yōu)點(diǎn):①蛋白質(zhì)芯片是一種高通量的研究方法,能在一次實(shí)驗(yàn)中提供相當(dāng)大的信息量,使我們能夠全面、準(zhǔn)確的研究蛋白表達(dá)譜,這是傳統(tǒng)的蛋白研究方法無(wú)法做到的。②蛋白質(zhì)組芯片的靈敏度高,它可以檢測(cè)出蛋白樣品中微量蛋白的存在,檢測(cè)水平已達(dá)ng級(jí)。美國(guó)科學(xué)家Haab等運(yùn)用綠色熒光 (green fluorescence)標(biāo)記抗體微陣列,用紅色熒光 (red fluorecence)標(biāo)記蛋白混和物,并運(yùn)用計(jì)算機(jī)識(shí)別 (R/G)的信號(hào)強(qiáng)弱,來(lái)進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)水平可達(dá)到 1ng/ml。③蛋白質(zhì)芯片具有高度的準(zhǔn)確性。
蛋白質(zhì)組芯片可用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的各個(gè)領(lǐng)域,具體來(lái)說(shuō)大致可分為三個(gè)方面:研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用,篩選新的蛋白質(zhì);蛋白質(zhì)芯片能夠用于現(xiàn)在其它方法不能檢測(cè)到的,如蛋白質(zhì)-藥物、蛋白質(zhì)-脂質(zhì)之間的相互作用;蛋白質(zhì)組芯片還可用于檢測(cè)蛋白與小分子物質(zhì)的作用。例如蛋白質(zhì)與DNA ,RNA分子等。蛋白質(zhì)芯片的制作是決定其運(yùn)用的關(guān)鍵因素之一,蛋白質(zhì)組芯片的制作比當(dāng)前流行DNA芯片制作要復(fù)雜,特別是涉及大量不同種類(lèi)的蛋白的高效表達(dá)與純化。因此,蛋白質(zhì)芯片制作存在費(fèi)時(shí)、費(fèi)力且成本較高等不足,限制了其在臨床的應(yīng)用。
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